gensarc 2008 : evaluation médico-économique de la détection moléculaire par hybridation in situ en fluorescence (fish) et par réaction en chaine à la polymérase (pcr) des translocations et amplifications spécifiques dans les sarcomes.

contexte les sarcomes sont des tumeurs conjonctives malignes rares, de l’enfant ou l’adulte, comprenant plus de 60 types, dont le diagnostic est difficile : les tumeurs conjonctives bénignes qui peuvent présenter des similitudes avec les sarcomes sont fréquentes et l’immunohistochimie n’est pas toujours résolutive. un diagnostic erroné peut avoir des conséquences néfastes sur la prise en charge : retard à l’instauration du traitement adapté, risque métastatique si une tumeur bénigne a été initialement évoquée à tort, séquelles et effets secondaires injustifiés dans le cas inverse, traitement inadéquat si un sarcome a été diagnostiqué pour une autre tumeur maligne. la détection moléculaire d’anomalies génétique spécifiques est une aide substantielle au diagnostic des sarcomes. toutefois, ces méthodes ont généralement été validées sur prélèvements congelés. or il est fréquent que la suspicion diagnostique ne survienne que a posteriori, le seul prélèvement disponible étant fixé. par exemple une tumeur apparaissant comme bénigne et dont l’exérèse chirurgicale n’est pas réalisée dans un centre spécialisé ne sera pas congelée. il a été démontré qu’il était possible de réaliser des analyses moléculaires sur ces fragments fixés, mais cette pratique n’a pas été évaluée de manière structurée pour les sarcomes. notre objectif est d’évaluer à grande échelle la réalisation des analyses moléculaires innovantes sur les prélèvements fixés dans 6 types de sarcomes, de comparer son intérêt aux analyses de référence sur prélèvements congelés et d’en étudier l’incidence médicale et économique. résumé de la recherche médico-économique notre étude repose sur la collaboration d’un réseau de 55 pathologistes experts en sarcomes (gsf) et de 8 centres de biologie moléculaire. les pathologistes du gsf incluent les cas à leur propre initiative ou à la demande de leurs correspondants. le nombre d’inclusions total prévu est 500 patients. les patients éligibles sont ceux pour lesquels un pathologiste du gsf établit ou confirme une suspicion de :-1) tumeur de la famille du sarcome d’ewing - -2) rhabdomyosarcomes alvéolaires - -3) synovialosarcomes - -4) liposarcomes dédifférenciés - -5) liposarcomes myxoïdes - -6) dermatofibrosarcomes. le pathologiste adresse une fiche détaillée d’inclusion au centre coordonnateur (chu nice) qui : -1) prend contact avec l’oncologue afin de s’assurer de la non-opposition du patient à son inclusion dans l’étude - -2) organise l’envoi des prélèvements aux centres de biologie moléculaire (voir ci-dessous « équipes partenaires »). les données collectées sont : 1) médicales : -i) hypothèses diagnostiques - -ii) résultats d’analyses moléculaires - -iii) diagnostics finalement retenus -iv) modalités de prise en charge thérapeutique - -2) économiques: -i) coûts directs des techniques de biologie moléculaires utilisées dans les huit centres de biologie moléculaires - -ii) coûts de prise en charge thérapeutique pour un sous-échantillon représentatif des patients inclus. la période initiale d’inclusion était de 2 ans suivis d’une année d’analyses post-inclusion. a la fin de ces 2 années, nous avons partiellement atteint nos objectifs, avec 254 inclusions en juin 2011 (309 le 31, 12, 2011). nous avons terminé les inclusions dans 2 groupes de sarcomes et réalisé leur analyse médico-économique. l’analyse des coûts directs des techniques est terminée (publication en cours). nous avons obtenu de la part de l’inca une prolongation d’une année, afin de terminer les inclusions. l’objet du présent projet est de demander un complément financier pour finaliser l’étude et exploiter les résultats. enjeux -egalité des patients vis à vis de l’accès au diagnostic moléculaire. -préservation des prélèvements en congélation, si réalisés, pour études complémentaires ultérieures. -simplification des procédures de conservation et de transport des prélèvements. -amélioration de la valeur informative des méthodes histologiques par l’utilisation complémentaire techniques moléculaires - amélioration des diagnostics. -amélioration de la prise en charge des patients diminution de l’errance diagnostique - diminution des effets secondaires de traitements injustifiés - amélioration des pronostics par instauration rapide des traitements et surveillance adéquats. -rationalisation des coûts des analyses moléculaires -diminution des coûts de traitements et d’examens biologiques ou cliniques liés à l’errance diagnostique. equipes partenaires centres de biologie moléculaire : 1) chu de nice, 2) institut bergonié, bordeaux , 3) institut curie, paris, 4) institut gustave roussy, villejuif, 5) institut paul strauss, strasbourg, 6) centre léon bérard, lyon, 7) chru de lille, 8) chu de strasbourg)

context sarcomas are rare connective malignant tumors of children and adults. their diagnosis is difficult since not only they comprise more than 60 types but also immunohistochemical analysis is not always sufficient for completing morphological analysis. misdiagnosis can induce harmful consequences for care management: delayed appropriate therapy, metastatic risk especially if the tumor was first considered as benign, side effects from unjustified treatments etc…molecular detection of specific genetic anomalies in sarcoma cells is a valuable ancillary tool for resolving difficulties of diagnosis. however these methods have usually been validated using frozen samples. in daily practice it is frequent not to have an available frozen sample, especially if the tumor has not been excised in a specialized center of if the lesion was initially thought to be benign. molecular analyses can nevertheless be performed on formalin-fixed paraffin-embedded samples, but this procedure has not been rationally evaluated for sarcomas. we aim to perform a large-scale evaluation of innovative molecular methods in fixed-paraffin embedded samples of six types of sarcomas and compare their interest to gold standard methods on frozen samples. moreover, our goal is to determine the medical and economic incidence of these methods. summary of the medico-economic research our study relies on a wide collaborative network of 55 pathologists expert in sarcomas (gsf) and 8 centers of molecular biology. pathologists include patients from their own institution or at the request of their correspondents (after validation). the total number of expected inclusions is 500. patients are included on the basis of suspicion of either: -1) tumors of ewing sarcoma family- -2) alveolar rhabdomyosarcomas- -3) synovial sarcomas- -4) dedifferentiated liposarcomas- -5) dermatofibrosarcoma protuberans- -6) myxoid liposarcomas. the gsf pathologist sends a detailed inclusion form to the coordinating center (nice university hospital) that: -1) get in touch with the oncologist in order to obtain the informed consent of the patient to be included- -2) organize the dispatching of samples towards the molecular biology centers. the gathered data are: 1) medical: -i) hypotheses of diagnoses- -ii) molecular results- -iii) final diagnoses- -iv) care management of patients. -2) economic: -i) direct costs of molecular biology methods performed in 8 centers of molecular biology--ii) direct costs of care and therapy for a representative subset of patients. the initial period of inclusions was 2 years followed by one year of post-inclusion analyses. after the first 2 years, we have partially met our goals with 254 inclusions in june 2011 (309 at december 31st, 2011). we have completed the inclusions in 2 types of sarcomas and started their medico-economic analysis. the analysis of direct costs of molecular methods is done (manuscript in preparation). the french national cancer institute has allowed us a prolongation of one year for the study, in order to meet our goal of 500 inclusions. the purpose of the present application is to request additional funding for completing the study and extensively analyze our results. issues equality of patients for access to molecular biology analyses- integral preservation of frozen samples, when available, for potential subsequent analyses if needed- simplification of conservation and transportation procedures to a molecular biology center- improvement of informative value of pathology methods by using ancillary molecular methods and better accuracy of diagnoses- improvement of the care management of patients by decreasing the erratic diagnoses, subsequent decreasing of side effects from inappropriate treatments and obtaining better prognosis by prompt adapted therapy- rationalization of costs of molecular biology analyses- decrease of therapeutic costs by avoiding erratic diagnoses