institut curie, ngs, diagnostic, routine

le service génétique de l'institut curie participe activement : - au diagnostic de prédisposition au cancer du sein et de l'ovaire, au cancer colorectal et au rétinoblastome, au niveau de son laboratoire d’oncogénétique (laboratoire 1 - unité de génétique constitutionnelle), - au diagnostic, au pronostic et à l’évaluation de la réponse aux traitements de nombreux cancers, au niveau de sa plateforme hospitalière de génétique moléculaire des cancers (laboratoires 2 et 3 - unité de pharmacogénomique et unité de génétique somatique). le séquençage de nouvelle génération est actuellement en train de profondément modifier plusieurs domaines de la recherche biomédicale, allant de la biologie fondamentale à la recherche translationnelle et maintenant à la médecine personnalisée. dans les trois unités du service de génétique, pour optimiser le débit et le délai d'exécution des tests génétiques, nous évoluons actuellement vers un diagnostic en routine à l’aide de la technologie ngs. cette évolution vers le ngs sera réalisée en partenariat avec la plateforme icgex ngs (laboratoire 4) et la plateforme de bio-informatique (laboratoire 5) de l'institut curie. le financement inca permettra une bonne coordination de ces différents partenaires pour atteindre les objectifs spécifiés.

the genetics service of institut curie is actively involved: - in the diagnosis of predisposition to breast and ovarian cancer, colorectal and gastric cancer, retinoblastoma, chromosomal breakage syndromes from its oncogenetics laboratory (laboratory 1 - constitutional genetics unit)- - in the diagnosis, prognosis, and treatment response of numerous cancers from its molecular genetics platform (laboratories 2 and 3 - pharmacogenomics unit and somatics genetics unit). next generation sequencing (ngs) technologies are profoundly impacting many domains of biomedical research, ranging from basic biology to translational research and now to personalize medicine. in the three laboratories, to optimize throughput and turnaround time, we are shifting to ngs routine diagnosis within 18 months. this ngs switch will be realized in partnership with the ngs icgex platform (laboratory 4) and the bioinformatics platform (laboratory 5) of institut curie. inca funding will allow adequate coordination of the partners’ efforts to achieve the goals specified above.