programme icgc sarcome d’ewing

le sarcome d’ewing (se) est la deuxième tumeur osseuse maligne primitive la plus courante chez les enfants et les adolescents après l’ostéosarcome. cliniquement, la survie des patients atteints de se a considérablement bénéficié de la chimiothérapie et de la radiothérapie. cependant, le pronostic des patients atteints de métastases au moment du diagnostic ou lors d’une rechute reste très mauvais. lancé en 2012, le but de ce projet est d’établir le catalogue des mutations somatiques qui peuvent coopérer avec la fusion ews-ets dans le développement et la progression de la tumeur et de comparer les signatures entre les tumeurs localisées et métastatiques. les premiers résultats, publiés dans la revue cancer discovery en septembre 2014, en collaboration avec le département de bioinformatique du st. jude children’s hopsital, ont abouti à l’identification d’une combinaison de deux altérations génétiques permettant d’identifier les formes très agressives des sarcomes d’ewing. en effet, ils observent une mutation du gène stag2 dans 17 % des cas et qui est le signe d’une tumeur de mauvais pronostic, de cdkn2a dans 12 % et de p53 dans 7 % des cas, puis des mutations dans des gènes modificateurs de chromatine. dans 3 % des cas, p53 et stag2 sont mutés et les tumeurs sont alors de très mauvais pronostic. d’autres analyses sont en cours pour confirmer les résultats initiaux, identifier de nouvelles mutations et étudier les fonctions de stag2 et de son association avec p53.

ewing sarcoma, the second most frequent primary bone tumor in children and young adults, is characterized by recurrent translocations involving ews family members and ets family members. the goal of the project is to establish the catalogue of somatic mutations that may cooperate with ews-ets fusion in the development of the tumor. the ewing’s sarcoma project aims to perform 100 whole genome sequencing of germline and tumor dna as well as at least 50 rna-seq from tumors. correlations between molecular profiles and clinical features will be established. the mutated genes will be further validated in a series of 500 es from our tumor bank.